17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1284 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1284  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750557  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1287  hypothetical protein  77.18 
 
 
206 aa  334  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0472629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0013  hypothetical protein  64.49 
 
 
245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6435  hypothetical protein  54.84 
 
 
245 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1285  hypothetical protein  79.1 
 
 
148 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0775421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0009  hypothetical protein  38.46 
 
 
251 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0010  hypothetical protein  37.14 
 
 
244 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2203  hypothetical protein  32.64 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6437  hypothetical protein  37.75 
 
 
243 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01371  hypothetical protein  40.21 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7467  hypothetical protein  28.85 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.418419  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01532  hypothetical protein  41.79 
 
 
108 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00273  hypothetical protein  46.55 
 
 
60 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  30.07 
 
 
484 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00497  hypothetical protein  54.76 
 
 
42 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00499  hypothetical protein  52.38 
 
 
42 aa  52.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00276  hypothetical protein  54.76 
 
 
42 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>