20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2308 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  100 
 
 
58 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  93.1 
 
 
58 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  89.66 
 
 
58 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  89.66 
 
 
58 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  89.66 
 
 
58 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  92.45 
 
 
53 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  75.86 
 
 
539 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  75.86 
 
 
539 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  75.86 
 
 
539 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  77.59 
 
 
539 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  75.86 
 
 
539 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  75.86 
 
 
539 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  64.81 
 
 
556 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  64.81 
 
 
555 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  59.65 
 
 
540 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  59.65 
 
 
540 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  56.9 
 
 
540 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  56.9 
 
 
540 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
487 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  49.09 
 
 
550 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>