20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1021 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1021  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  327  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0159  hypothetical protein  98.8 
 
 
166 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0455  hypothetical protein  86.75 
 
 
153 aa  255  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1328  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2754  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2612  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0185  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1142  hypothetical protein  61.86 
 
 
106 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71833  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1858  hypothetical protein  51.82 
 
 
117 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6000  hypothetical protein  58.33 
 
 
116 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4237  hypothetical protein  53.12 
 
 
117 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257801  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4013  hypothetical protein  54.17 
 
 
116 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4354  hypothetical protein  54.17 
 
 
116 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5568  hypothetical protein  46.23 
 
 
115 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3763  hypothetical protein  52.08 
 
 
117 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.106904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1666  hypothetical protein  55.56 
 
 
131 aa  87.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0340303  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2438  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  31.07 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4090  cold-shock DNA-binding protein family protein  31.31 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.25862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0905  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.53 
 
 
195 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.489949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3849  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  30.1 
 
 
196 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>