44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3027 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  99.58 
 
 
237 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  99.58 
 
 
237 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  70.64 
 
 
233 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  68.49 
 
 
236 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  71.24 
 
 
233 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  70.64 
 
 
232 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  69.37 
 
 
236 aa  277  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  69.37 
 
 
236 aa  277  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  69.23 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  69.63 
 
 
234 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  70.21 
 
 
234 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  61.97 
 
 
233 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  47.42 
 
 
222 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  47.6 
 
 
222 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  46.6 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  42.56 
 
 
223 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  42.18 
 
 
216 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  30 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  32.93 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  33.91 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  33.33 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  29.59 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  29.24 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  29.24 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  28.93 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  24.88 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  28.65 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  28.93 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1319  hypothetical protein  27.41 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0555  putative lipoprotein  29.73 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.824529  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2012  hypothetical protein  28.81 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1462  hypothetical protein  28.04 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  25.89 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>