18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0108 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0108  putative lipoprotein  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0101  putative lipoprotein  99.13 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1589  hypothetical protein  98.7 
 
 
230 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0134  putative lipoprotein  98.7 
 
 
230 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1287  hypothetical protein  71.74 
 
 
249 aa  317  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180976  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3982  hypothetical protein  70 
 
 
230 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.122943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4558  hypothetical protein  71.3 
 
 
229 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396699  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5746  hypothetical protein  71.3 
 
 
229 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0879668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3810  hypothetical protein  71.3 
 
 
229 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4446  hypothetical protein  70 
 
 
230 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4090  hypothetical protein  68.7 
 
 
229 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6632  hypothetical protein  64.6 
 
 
243 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311637  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  52.61 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0512  hypothetical protein  41.57 
 
 
239 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1103  hypothetical protein  45.36 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  43.75 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  38.32 
 
 
546 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  40.66 
 
 
525 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>