28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0975 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0616  hypothetical protein  72.73 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.173694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  67.07 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  62.5 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  62.2 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  62.2 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  53.09 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  51.72 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0417  protein of unknown function DUF497  48 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  35.37 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  35.37 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  36.14 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  29.55 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  37.65 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  30.59 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  31.71 
 
 		 97 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  32.95 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  33.78 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>