40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0515 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0519    100 
 
 
268 bp  446  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0515    100 
 
 
225 bp  446  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291374  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  92.44 
 
 
267 bp  311  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  92.44 
 
 
267 bp  311  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  91.07 
 
 
267 bp  285  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  91.07 
 
 
267 bp  285  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  91.07 
 
 
267 bp  285  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    93.01 
 
 
1092 bp  266  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  82.14 
 
 
267 bp  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  82.06 
 
 
321 bp  125  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1568    82.14 
 
 
266 bp  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2592    81.91 
 
 
257 bp  101  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.743625  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3393    92.98 
 
 
304 bp  81.8  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  79.56 
 
 
267 bp  81.8  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  79.56 
 
 
267 bp  81.8  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  79.56 
 
 
267 bp  81.8  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  79.56 
 
 
267 bp  81.8  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  83.64 
 
 
1182 bp  75.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2385  transposase IS3/IS911 family protein  82.76 
 
 
213 bp  71.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0069    90.2 
 
 
105 bp  61.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  83.75 
 
 
267 bp  56  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  83.75 
 
 
267 bp  56  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  83.75 
 
 
267 bp  56  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  83.75 
 
 
267 bp  56  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    83.75 
 
 
1992 bp  56  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  84.51 
 
 
267 bp  54  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4004    88 
 
 
204 bp  52  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  88 
 
 
267 bp  52  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  82.72 
 
 
324 bp  50.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  88.89 
 
 
267 bp  50.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3887    88.89 
 
 
261 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3868    88.89 
 
 
261 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  80.58 
 
 
264 bp  46.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  80.58 
 
 
264 bp  46.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  80.58 
 
 
264 bp  46.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  89.74 
 
 
285 bp  46.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  89.74 
 
 
498 bp  46.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03602  ISXoo3 transposase ORF A  89.74 
 
 
264 bp  46.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03025  ISXoo3 transposase ORF A  89.74 
 
 
264 bp  46.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.752388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  80.58 
 
 
264 bp  46.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>