38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1583 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0390  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2851  chorismate lyase  100 
 
 		 105 aa  213  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1768  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1583  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1215  chorismate lyase superfamily protein  90.09 
 
 		 184 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2976  4-hydroxybenzoate synthetase  100 
 
 		 56 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0710  chorismate lyase  54.44 
 
 		 185 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00949148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2859  chorismate lyase  40 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0823  Chorismate lyase  43.68 
 
 		 197 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3058  chorismate lyase  38.89 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2614  Chorismate lyase  37.76 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3024  Chorismate lyase  38.64 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2780  hypothetical protein  36.46 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2367  chorismate lyase  33.75 
 
 		 198 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0933  chorismate lyase  35 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2382  chorismate lyase  33.75 
 
 		 197 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2262  chorismate lyase  33.75 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1734  chorismate lyase  33.75 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1946  chorismate lyase family protein  35.8 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0290  chorismate lyase family protein  35.8 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1319  chorismate lyase family protein  35.8 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1168  chorismate--pyruvate lyase  35.8 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5685  chorismate lyase  33.75 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1159  chorismate--pyruvate lyase  35.8 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0858  chorismate lyase family protein  35.8 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2612  chorismate lyase  34.83 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1006  chorismate lyase family protein  35.8 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.998133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2346  chorismate lyase  33.75 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3325  chorismate lyase  34.44 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1221  Chorismate lyase  34.07 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0956  chorismate lyase family protein  34.57 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5225  chorismate lyase  39.76 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5317  chorismate lyase  39.76 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5364  chorismate lyase  35.96 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0157  chorismate lyase  38.1 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0066  chorismate lyase  34.72 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.540538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0464  chorismate lyase  34.52 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48500  Chorismate lyase  37.84 
 
 		 183 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>