57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0685 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0685    100 
 
 
297 bp  589  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0496  hypothetical protein  100 
 
 
297 bp  589  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  99.63 
 
 
990 bp  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  99.63 
 
 
1002 bp  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  99.27 
 
 
990 bp  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0981    100 
 
 
177 bp  351  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1953    100 
 
 
177 bp  351  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  91.45 
 
 
987 bp  347  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  100 
 
 
10059 bp  58  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0621    100 
 
 
10059 bp  58  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1233  ISBma1, transposase, interruption-C  100 
 
 
498 bp  58  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1176  hypothetical protein  100 
 
 
651 bp  54  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1994  ISBma2, transposase  100 
 
 
1530 bp  54  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.552518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2294  ISBma2, transposase  100 
 
 
1530 bp  54  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2132  hypothetical protein  100 
 
 
117 bp  52  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0440    100 
 
 
108 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1076    100 
 
 
336 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1816    100 
 
 
459 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  100 
 
 
1560 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2230  hypothetical protein  100 
 
 
933 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3406  transposase OrfA  100 
 
 
180 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  100 
 
 
1551 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0487    100 
 
 
459 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2050    100 
 
 
336 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1293    100 
 
 
156 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.789728  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
780 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0302  amino acid adenylation  100 
 
 
156 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0482    100 
 
 
246 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0587    100 
 
 
228 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1076    100 
 
 
294 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  100 
 
 
324 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1297  hypothetical protein  100 
 
 
189 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0173    100 
 
 
90 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  100 
 
 
459 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1053  hypothetical protein  100 
 
 
1158 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.74132  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1413    100 
 
 
467 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1790  hypothetical protein  100 
 
 
336 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35129  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.85 
 
 
987 bp  52  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4453    96.67 
 
 
1000 bp  52  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.85 
 
 
987 bp  52  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0783    100 
 
 
336 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0151  transposase  100 
 
 
213 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1485    100 
 
 
1221 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.471497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1784    100 
 
 
189 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.674387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2899  ISBma1, transposase  100 
 
 
192 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  52  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.62 
 
 
987 bp  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>