31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1012 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1039    100 
 
 
1176 bp  2331    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0745499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  99.83 
 
 
1722 bp  2315    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1012    100 
 
 
1176 bp  2331    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1485    100 
 
 
1221 bp  2331    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.471497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0154    100 
 
 
1176 bp  2331    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  99.74 
 
 
1722 bp  2307    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  99.66 
 
 
1722 bp  2300    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  94.34 
 
 
1740 bp  81.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  85.53 
 
 
1788 bp  63.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  91.67 
 
 
2010 bp  63.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  85.33 
 
 
1719 bp  61.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  88.68 
 
 
1746 bp  58  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  100 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  89.58 
 
 
1842 bp  56  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  89.58 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  100 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  89.58 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  93.94 
 
 
1656 bp  50.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  86.79 
 
 
1746 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  87.76 
 
 
1806 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  87.76 
 
 
2013 bp  50.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  88.64 
 
 
1863 bp  48.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  100 
 
 
22626 bp  48.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
3216 bp  48.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>