17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0033 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0033  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  540  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.809592 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5234  hypothetical protein  45.37 
 
 
239 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3759  hypothetical protein  37.02 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0529  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  0.851974 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0628  hypothetical protein  32.46 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.141009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2511  hypothetical protein  29.59 
 
 
253 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3633  hypothetical protein  27.03 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0392444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1644  hypothetical protein  21.69 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  48.98 
 
 
133 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  40 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1485  hypothetical protein  39.68 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  46.94 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  44.23 
 
 
135 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  46.94 
 
 
133 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3541  hypothetical protein  26.97 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  38.3 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0461  hypothetical protein  45.83 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>