15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7863 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7863  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  35.56 
 
 
286 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  38.13 
 
 
292 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  44.7 
 
 
277 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1965  hypothetical protein  37.45 
 
 
282 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1992  hypothetical protein  37.45 
 
 
282 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  41.29 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.07 
 
 
951 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  29.8 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  30.41 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.04 
 
 
366 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  28.12 
 
 
409 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  28.32 
 
 
345 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  30.77 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1092  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.38 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>