13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6578 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6578  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  26.17 
 
 		 258 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  32.63 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.72 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  31.58 
 
 		 208 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  31.58 
 
 		 208 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  30.53 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  30.53 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7166  hypothetical protein  35.96 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  26.67 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>