25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3603 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  980    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  53.77 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  47.67 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  47.58 
 
 		 584 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  47.03 
 
 		 582 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  28.81 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  26.38 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  28.81 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  28.33 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  28.6 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  27.11 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  28.6 
 
 		 478 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  28.6 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4269  hypothetical protein  24.05 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  26.81 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  26.5 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  24.14 
 
 		 410 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  23.65 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  26.5 
 
 		 411 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  23.02 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  25 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>