26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3142 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  45.45 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  47.5 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  47.5 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  49.32 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  54.67 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  49.28 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  50 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  48.57 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  45.95 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  50.67 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  43.84 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  45.71 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  45.71 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  43.06 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3288  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0275499  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1891  hypothetical protein  41.03 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  41.89 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0559  protein of unknown function DUF1636  36.49 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2530  hypothetical protein  38.16 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0227  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0741  hypothetical protein  41.67 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  31.58 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  32.39 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>