19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2965 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  63.75 
 
 		 80 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  62.5 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  53.03 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  44.16 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  38.96 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  59.52 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  38.16 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  48 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  44.9 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  41.56 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  39.44 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  42.03 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0981  hypothetical protein  38.98 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644119  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0455  hypothetical protein  42.59 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>