59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1814 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7153  transposase  99.78 
 
 
1110 bp  896    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  99.78 
 
 
1110 bp  896    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  99.78 
 
 
1110 bp  896    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1814    100 
 
 
456 bp  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628479  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0246  transposase, IS4  86.08 
 
 
726 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.261546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0014  transposase, IS4  86.08 
 
 
726 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0462942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2500  transposase, IS4  86.08 
 
 
726 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  86.08 
 
 
1110 bp  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1692  transposase, IS4  87.7 
 
 
408 bp  319  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1380    87.7 
 
 
428 bp  319  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  85.29 
 
 
804 bp  83.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1376  ISGsu2, transposase  85.56 
 
 
807 bp  75.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5975    90.32 
 
 
895 bp  75.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100438  normal  0.316362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2609  hypothetical protein  92.16 
 
 
621 bp  69.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.763724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  87.5 
 
 
1095 bp  56  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  91.89 
 
 
1098 bp  50.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2810  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  96.43 
 
 
966 bp  48.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0227  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0751226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0980  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1580  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2687  prophage LambdaMc01, ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.765288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2964  ISMca1, transposase  91.67 
 
 
1101 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  96.3 
 
 
1263 bp  46.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2291    91.43 
 
 
478 bp  46.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  96.3 
 
 
2757 bp  46.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>