More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1805 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  56.99 
 
 		 678 aa  735    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  58.22 
 
 		 678 aa  748    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  78.78 
 
 		 696 aa  1078    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  79.39 
 
 		 688 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  79.69 
 
 		 683 aa  1090    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  80.31 
 
 		 682 aa  1086    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  80.15 
 
 		 683 aa  1084    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  81.07 
 
 		 699 aa  1099    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  57.93 
 
 		 671 aa  724    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  100 
 
 		 655 aa  1323    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  47.09 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  46.54 
 
 		 675 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  46.54 
 
 		 681 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  47.02 
 
 		 669 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  47.17 
 
 		 667 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  45.27 
 
 		 688 aa  575  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  46.47 
 
 		 670 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  46.85 
 
 		 680 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  45.69 
 
 		 678 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  45.69 
 
 		 678 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  46.17 
 
 		 676 aa  552  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  47.49 
 
 		 686 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  45.34 
 
 		 642 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  45.51 
 
 		 662 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  44.44 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  43.68 
 
 		 661 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  38.16 
 
 		 653 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  38.27 
 
 		 653 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.63 
 
 		 692 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  33.08 
 
 		 688 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.55 
 
 		 673 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  35.19 
 
 		 692 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.73 
 
 		 691 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  33.03 
 
 		 679 aa  360  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  32.69 
 
 		 691 aa  360  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  33.23 
 
 		 689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.93 
 
 		 701 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  32.24 
 
 		 695 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  35.09 
 
 		 673 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  32.73 
 
 		 695 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  33.63 
 
 		 688 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  33.48 
 
 		 689 aa  351  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  32.78 
 
 		 701 aa  351  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  32.34 
 
 		 700 aa  349  9e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  34.05 
 
 		 682 aa  349  9e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  33.13 
 
 		 689 aa  348  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.33 
 
 		 694 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  35.02 
 
 		 680 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  33.43 
 
 		 692 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  32.39 
 
 		 692 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.64 
 
 		 692 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  32.3 
 
 		 699 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  32.54 
 
 		 692 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.43 
 
 		 686 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  33.13 
 
 		 689 aa  344  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  33.14 
 
 		 691 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  32.23 
 
 		 697 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  31.95 
 
 		 682 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  31.44 
 
 		 693 aa  341  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.13 
 
 		 692 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  31.51 
 
 		 696 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  30.47 
 
 		 696 aa  340  5.9999999999999996e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  31.44 
 
 		 696 aa  340  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  32.63 
 
 		 692 aa  339  9.999999999999999e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  31.7 
 
 		 697 aa  339  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  32.14 
 
 		 694 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  32.35 
 
 		 692 aa  339  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  32.4 
 
 		 703 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  32.79 
 
 		 704 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  32.78 
 
 		 686 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  32.22 
 
 		 695 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  32.94 
 
 		 691 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  32.45 
 
 		 692 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.37 
 
 		 696 aa  336  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  33.28 
 
 		 690 aa  336  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  32.24 
 
 		 692 aa  336  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  34.28 
 
 		 690 aa  335  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  31.64 
 
 		 695 aa  335  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  32.18 
 
 		 691 aa  335  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  32.89 
 
 		 706 aa  334  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  31.63 
 
 		 691 aa  334  4e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.03 
 
 		 697 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  31.59 
 
 		 692 aa  333  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  31.98 
 
 		 692 aa  333  6e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  31.99 
 
 		 692 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  32.79 
 
 		 689 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  31.94 
 
 		 692 aa  333  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  32.88 
 
 		 696 aa  333  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  32.38 
 
 		 688 aa  333  8e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  33.04 
 
 		 691 aa  333  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  31.45 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  31.45 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  31.45 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  31.45 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  32.79 
 
 		 695 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  31.45 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  31.03 
 
 		 692 aa  331  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  32.44 
 
 		 698 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  31.65 
 
 		 692 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  32.93 
 
 		 695 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>