21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1467 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  88.16 
 
 
397 aa  717    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  82.58 
 
 
398 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  85.1 
 
 
397 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  84.01 
 
 
398 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  88.41 
 
 
397 aa  720    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  73.82 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  73.51 
 
 
396 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  72.73 
 
 
396 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  73.82 
 
 
398 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  73.49 
 
 
401 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  72.45 
 
 
403 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  72.97 
 
 
403 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  70.65 
 
 
398 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  53.12 
 
 
402 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  84.39 
 
 
235 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  77.71 
 
 
167 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  70.52 
 
 
393 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  63.64 
 
 
172 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  23.21 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2917  hypothetical protein  26.57 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>