167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0487 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  100 
 
 
187 aa  360  8e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  46.74 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  47.62 
 
 
192 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  47.62 
 
 
192 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  47.27 
 
 
199 aa  158  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0561  colicin V production protein  49.4 
 
 
191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  42.55 
 
 
208 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  40.96 
 
 
210 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  44.65 
 
 
234 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  43.4 
 
 
195 aa  141  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0488  CvpA protein  66.42 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.888997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  41.76 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  37.57 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  45.96 
 
 
208 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  43.4 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  40.21 
 
 
238 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1043  Colicin V production protein  45.96 
 
 
206 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  40.44 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  41.21 
 
 
204 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  38.8 
 
 
213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  35.87 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  35.29 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  35.29 
 
 
197 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  35.84 
 
 
202 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4630  Colicin V production protein  37.2 
 
 
198 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  34.97 
 
 
198 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  38.78 
 
 
232 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  31.88 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  31.45 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  29.27 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  31.94 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  31.94 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  31.94 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1711  colicin V production protein  28.41 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  31.94 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  27.27 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  30 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1785  colicin V production protein  34.31 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.170102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  30.43 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  27.39 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  30.07 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  30.56 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1805  colicin V production protein  23.84 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  28.03 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2130  putative colicin V production protein  28.92 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  26.75 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  28.57 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  26.75 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  26.75 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  26.75 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  26.75 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  30.22 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.530952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  26.54 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  28.68 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  28.31 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  27.94 
 
 
162 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  31.94 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  30.56 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  30.56 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  31.25 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2503  colicin V production protein  25.93 
 
 
207 aa  61.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  26.53 
 
 
168 aa  61.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  30.22 
 
 
162 aa  61.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  31.29 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  26.81 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  26.09 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  26.09 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  26.81 
 
 
162 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  26.95 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  26.62 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  26.62 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  26.09 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.71 
 
 
163 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  26.62 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  26.62 
 
 
162 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  29.75 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  28.78 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  25.9 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  28.06 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  24.07 
 
 
165 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  23.12 
 
 
164 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  28.3 
 
 
163 aa  57.8  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  26.81 
 
 
162 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  31.45 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  25.9 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  25.9 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>