33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  100 
 
 
779 aa  1555    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  45.09 
 
 
366 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  44.36 
 
 
359 aa  181  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  36.25 
 
 
380 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  34.49 
 
 
328 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  33.7 
 
 
335 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  34.2 
 
 
361 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  36.33 
 
 
374 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  36.33 
 
 
369 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  35.13 
 
 
349 aa  105  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  28.3 
 
 
334 aa  97.8  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  37.89 
 
 
339 aa  93.6  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  30.79 
 
 
456 aa  93.6  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  34.07 
 
 
323 aa  87  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  37.31 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  31.84 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  30.19 
 
 
318 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  27.82 
 
 
324 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  33.48 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  31.13 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  30.08 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  35.1 
 
 
324 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  29.81 
 
 
306 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  28.91 
 
 
319 aa  65.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  28.45 
 
 
245 aa  65.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  30.29 
 
 
302 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  31.54 
 
 
342 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.48 
 
 
350 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  24.9 
 
 
241 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3078  hypothetical protein  28.43 
 
 
294 aa  57.4  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.772743  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  38.03 
 
 
331 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  31.41 
 
 
395 aa  45.8  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>