60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41880  Transposase IS3/IS911  100 
 
 
94 aa  191  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40540  Transposase IS3/IS911  100 
 
 
94 aa  191  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09770  Transposase IS3/IS911  100 
 
 
94 aa  191  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  100 
 
 
92 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  100 
 
 
92 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0766  transposase IS3/IS911 family protein  60.49 
 
 
97 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1287  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 
97 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 
97 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  61.25 
 
 
99 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  61.25 
 
 
98 aa  87  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  58.75 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  58.75 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  58.75 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  58.75 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  58.75 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  57.5 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  57.5 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  56.25 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  56.25 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  54.43 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  58.75 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  52.5 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  55.93 
 
 
70 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4159  putative transposase  58.14 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.137992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  32.43 
 
 
106 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  42.67 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0424  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1050  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3020  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>