11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7468 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7468    100 
 
 		 153 bp  303  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  98.04 
 
 		 858 bp  280  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7697    97.39 
 
 		 153 bp  272  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3989  IS3 family transposase  94.77 
 
 		 498 bp  240  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2715  IS3 family transposase  89.63 
 
 		 135 bp  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4611    86.3 
 
 		 387 bp  131  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1659    83.97 
 
 		 240 bp  93.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 798 bp  56  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 798 bp  56  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 798 bp  56  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 798 bp  56  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>