18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5814 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5814  recombination regulator RecX  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4526  recombination regulator RecX  54.24 
 
 		 191 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4261  recombination regulator RecX  51.45 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  32.77 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1418  hypothetical protein  34.35 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  32.09 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  29.22 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3064  hypothetical protein  29.57 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  24.18 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  24.18 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1166  regulatory protein RecX  25 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  23.81 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  43.84 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  36.11 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  39.13 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  27.81 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  25.49 
 
 		 214 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>