38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3289 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3289    100 
 
 		 372 bp  737    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  99.73 
 
 		 372 bp  729    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  100 
 
 		 372 bp  737    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  99.73 
 
 		 372 bp  729    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  81.41 
 
 		 764 bp  159  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  81.41 
 
 		 764 bp  159  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  81.41 
 
 		 764 bp  159  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  81.41 
 
 		 764 bp  159  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  81.41 
 
 		 764 bp  159  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  81.2 
 
 		 312 bp  123  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4790    88.75 
 
 		 192 bp  87.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  78.27 
 
 		 429 bp  81.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  84.11 
 
 		 429 bp  77.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  77.96 
 
 		 429 bp  73.8  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  77.96 
 
 		 429 bp  73.8  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  77.96 
 
 		 429 bp  73.8  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  79.89 
 
 		 764 bp  71.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  79.89 
 
 		 764 bp  71.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  79.89 
 
 		 764 bp  71.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  79.89 
 
 		 764 bp  71.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  79.89 
 
 		 764 bp  71.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  79.89 
 
 		 764 bp  71.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0559    77.7 
 
 		 396 bp  65.9  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.610856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2652    83.52 
 
 		 855 bp  61.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.555909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  79.31 
 
 		 399 bp  60  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  79.31 
 
 		 399 bp  60  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3288    100 
 
 		 420 bp  58  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0525    77.38 
 
 		 363 bp  58  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  81.08 
 
 		 366 bp  54  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6466    87.76 
 
 		 174 bp  50.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  100 
 
 		 417 bp  50.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4791    87.76 
 
 		 254 bp  50.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  93.75 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3954    93.75 
 
 		 754 bp  48.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  91.43 
 
 		 315 bp  46.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  91.43 
 
 		 315 bp  46.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  91.43 
 
 		 315 bp  46.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>