43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1872 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1872  Purine nucleoside permease protein  100 
 
 		 364 aa  746    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1619  purine nucleoside permease  59.23 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1496  putative purine nucleoside permease  60.06 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0815  purine nucleoside permease  46.2 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0745  purine nucleoside permease  48.69 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.64688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0798  putative purine nucleoside permease protein  46.34 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4629  purine nucleoside permease  44.63 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00101608  normal  0.109746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2112  putative lipoprotein  43.7 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3369  purine nucleoside permease  43.65 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0409  purine nucleoside permease family protein  41.81 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0822  putative lipoprotein  41.81 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2138  putative lipoprotein  41.81 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1471  putative lipoprotein  41.81 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4530  purine nucleoside permease  40.41 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0507  purine nucleoside permease family protein  45.28 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0845  CNT family concentrative nucleoside/H+ anitporter  40.7 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673784  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1835  putative lipoprotein  45.28 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4706  purine nucleoside permease  44.19 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0697594  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5237  purine nucleoside permease  44.19 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0289  purine nucleoside transporter  44.19 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5356  purine nucleoside permease  44.19 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3010  purine nucleoside permease  44.19 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4914  purine nucleoside permease  44.19 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.78554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3859  purine nucleoside permease  41.52 
 
 		 343 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4123  purine nucleoside permease, putative  41.51 
 
 		 343 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0816  purine nucleoside permease  40.96 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0746  purine nucleoside permease  41.14 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119389  normal  0.778761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0799  putative purine nucleoside permease protein  42.67 
 
 		 346 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3758  purine nucleoside permease  41.42 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10683  purine nucleoside permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00810)  35.63 
 
 		 396 aa  205  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76929  purine nucleoside permease  35.87 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.638652 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31020  purine nucleoside permease  34.97 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171142  normal  0.23144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1232  purine nucleoside permease  38.51 
 
 		 354 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3260  purine nucleoside permease  34.73 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  35.19 
 
 		 575 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4184  purine nucleoside permease  34.07 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1321  purine nucleoside permease  32.13 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.435473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0849  purine or other phosphorylase family 1  33.45 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0564  purine nucleoside permease  32.01 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1764  putative purine nucleoside permease protein  27.83 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.319131  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2814  purine nucleoside permease  30.34 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0774  phosphorylase, putative  29.37 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0917  Purine nucleoside permease-like protein  29.37 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>