28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0702 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5720  hypothetical protein  83.33 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175303  normal  0.62585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5124  hypothetical protein  88.68 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  56.45 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  53.97 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  52.38 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  52.38 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0410  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  52.38 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  52.38 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  50.79 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3864  hypothetical protein  47.62 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.429086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  49.21 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  46.88 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  49.21 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  47.54 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  47.54 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  45.9 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46620  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4803  hypothetical protein  39.06 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0179772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0631  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5816  hypothetical protein  47.54 
 
 		 67 aa  48.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595083  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.908723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0851  hypothetical protein  35.94 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.631847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0231  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1883  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00517527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>