27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0158 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  284  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  66.12 
 
 
142 aa  184  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  73.98 
 
 
130 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0227  hypothetical protein  47.11 
 
 
129 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  36.07 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  37.19 
 
 
119 aa  84.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  38.98 
 
 
119 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  33.9 
 
 
133 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  35.83 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  38.14 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  35.48 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  32.52 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1891  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  32.52 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3288  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0275499  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  35.34 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  34.11 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  30.08 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0559  protein of unknown function DUF1636  31.67 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2530  hypothetical protein  35.77 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  41.89 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  28.69 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0329  hypothetical protein  28.93 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0741  hypothetical protein  31.97 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  24.37 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2221  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>