27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3437 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3437  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  350  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0689  hypothetical protein  75.6 
 
 
168 aa  267  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5263  protein of unknown function DUF177  57.49 
 
 
167 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23091  normal  0.0658863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0963  protein of unknown function DUF177  49.7 
 
 
167 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0371  protein of unknown function DUF177  50.3 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223895  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0364  protein of unknown function DUF177  50.3 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4712  hypothetical protein  47.31 
 
 
169 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0945852  normal  0.92586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1619  metal-binding protein  42.11 
 
 
168 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.056507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1788  hypothetical protein  39.86 
 
 
172 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.190801  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0576  hypothetical protein  40.74 
 
 
178 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  34.42 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  26.57 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  27.63 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  26.39 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1354  protein of unknown function DUF177  25.95 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000453474  normal  0.152935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  25.55 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1284  hypothetical protein  27.21 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  27.21 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  26.14 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1328  hypothetical protein  30.61 
 
 
175 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000416974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  26.81 
 
 
178 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  25.55 
 
 
185 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  27.54 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0649  hypothetical protein  26.17 
 
 
202 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.865201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  25.77 
 
 
186 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  25.77 
 
 
186 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  24.56 
 
 
178 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000360622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>