17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2373 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2373  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  242  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960402  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3172  hypothetical protein  73.28 
 
 
116 aa  189  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2522  protein of unknown function UPF0153  68.1 
 
 
117 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.245259  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3592  protein of unknown function UPF0153  67.24 
 
 
117 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  65.52 
 
 
220 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4540  protein of unknown function UPF0153  68.75 
 
 
116 aa  169  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2303  hypothetical protein  60.34 
 
 
122 aa  164  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.798576  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  57.76 
 
 
116 aa  159  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14501  Fe-S-cluster oxidoreductase  43.86 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1158  hypothetical protein  46.85 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.308257  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  42.61 
 
 
115 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1317  hypothetical protein  41.44 
 
 
124 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  39.13 
 
 
115 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  40 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  39.13 
 
 
115 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09121  Fe-S-cluster oxidoreductase  35.14 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.598462  hitchhiker  0.00000874271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  36.25 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>