43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2054 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2054  50S ribosomal protein L25  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3523  Ribosomal protein L25-like protein  84.38 
 
 		 98 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0707  50S ribosomal protein L25  56.38 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0736  50S ribosomal protein L25  56.38 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4741  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  53.61 
 
 		 198 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3283  50S ribosomal protein L25  55.67 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228774  normal  0.044405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2531  50S ribosomal protein L25  58.06 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2818  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  36.26 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2003  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  38.75 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000475903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1635  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  34.83 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1377  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.79 
 
 		 207 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0346  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.246778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2115  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  29.59 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3946  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.53 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3653  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.21 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00224871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1041  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.26 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000685221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2392  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.12 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_002978  WD0174  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  31.76 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.118362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3746  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  27.84 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0677  50S ribosomal protein L25P  34.34 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2415  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  30.53 
 
 		 202 aa  43.5  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.203941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1617  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.57 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_002950  PG0167  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.33 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1127  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.1 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0721  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.57 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2285  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  35.35 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1454  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.86 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0765  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.57 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2403  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.92 
 
 		 228 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.680748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1803  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  28.21 
 
 		 202 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4462  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.8 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2145  ribosomal protein L25  28.21 
 
 		 202 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1674  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  25.77 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2475  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.92 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0673  ribosomal protein L25  33.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2698  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  28.92 
 
 		 228 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1472  ribosomal 5S rRNA E-loop binding protein Ctc/L25/TL5  31.96 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.294913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0171  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  30.12 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850595 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0784  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  33.66 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2819  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  27.71 
 
 		 211 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0078  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  32.99 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.514827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0142  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  34.94 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3558  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  35.05 
 
 		 211 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>