26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0255 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  271  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  75.97 
 
 
142 aa  214  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  73.98 
 
 
136 aa  177  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0227  hypothetical protein  45.08 
 
 
129 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  36.75 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  39.32 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  35.9 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  38.33 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  38.33 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  36.13 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  36.29 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1891  hypothetical protein  38.33 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  34.96 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  36.75 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  32.33 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  48.57 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  32.52 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3288  hypothetical protein  34.92 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0275499  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  28.8 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  30.53 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  38.96 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0559  protein of unknown function DUF1636  31.67 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0741  hypothetical protein  35.34 
 
 
180 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2530  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0329  hypothetical protein  27.5 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  26.27 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>