92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1325 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.51 
 
 
344 aa  95.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.97 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.82 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  30.43 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.82 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.06 
 
 
580 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.05 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.83 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.87 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  32.07 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.3 
 
 
219 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1959  hypothetical protein  30.71 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.14 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.49 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.32 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.57 
 
 
197 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.84 
 
 
222 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  27.51 
 
 
218 aa  57.8  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.22 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.77 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.57 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.13 
 
 
216 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  26.88 
 
 
208 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  27.44 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  30.32 
 
 
220 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.46 
 
 
205 aa  54.7  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.27 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  24.69 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.99 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  26.34 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.44 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  25.13 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.65 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.35 
 
 
220 aa  51.2  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.88 
 
 
233 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.41 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  25.14 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  22.63 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3236  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.67 
 
 
222 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  25.13 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  22.95 
 
 
206 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.76 
 
 
222 aa  48.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  25.13 
 
 
209 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.3 
 
 
217 aa  48.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  25.13 
 
 
209 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  23.56 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  22.04 
 
 
212 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  22.4 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  22.92 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.02 
 
 
259 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  22.4 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  22.4 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  26.73 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  21.86 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.53 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  23.16 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  25 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  27.51 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.81 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  26.2 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  26.92 
 
 
230 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  24.19 
 
 
209 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  22.81 
 
 
207 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  31 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  24.46 
 
 
206 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.81 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.46 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  25.13 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  24.46 
 
 
206 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  24.46 
 
 
206 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  24.46 
 
 
206 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  24.46 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.3 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.46 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.91 
 
 
229 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.91 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  22.91 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  24.46 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  24.46 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  26.99 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  25.93 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  22.68 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  24 
 
 
215 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.12 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  24.46 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.46 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  22.96 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  26.98 
 
 
202 aa  41.6  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.87 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  21.99 
 
 
208 aa  40.8  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>