More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0948 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0948  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  38.46 
 
 
229 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  38.42 
 
 
206 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19970  dephospho-CoA kinase  37.89 
 
 
206 aa  99  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  33.17 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  37.63 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  36.27 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1520  dephospho-CoA kinase  35.03 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0885  dephospho-CoA kinase  31.34 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  32.47 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3019  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.99 
 
 
385 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156562  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11647  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  34.04 
 
 
407 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.644791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05310  dephospho-CoA kinase  34 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.99 
 
 
385 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.99 
 
 
385 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  36.08 
 
 
395 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11180  dephospho-CoA kinase  35.38 
 
 
215 aa  87.8  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2074  dephospho-CoA kinase  29.41 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000294948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2433  dephospho-CoA kinase  30.48 
 
 
296 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  33.17 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2870  dephospho-CoA kinase  35.33 
 
 
306 aa  84.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  33.87 
 
 
317 aa  84.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3026  dephospho-CoA kinase  35.71 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00288343  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0744  dephospho-CoA kinase  32.65 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0276595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0148  dephospho-CoA kinase  32.45 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1423  dephospho-CoA kinase  30.21 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2519  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645615  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1091  dephospho-CoA kinase  38.19 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.226382  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4423  dephospho-CoA kinase  29.35 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1323  dephospho-CoA kinase  33 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.018005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.84 
 
 
392 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.63 
 
 
410 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1561  dephospho-CoA kinase  29.84 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1582  dephospho-CoA kinase  32.46 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  33 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2014  dephospho-CoA kinase  32.67 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2155  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  36.09 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1134  dephospho-CoA kinase  32.16 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  32.47 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1105  dephospho-CoA kinase  33 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.323015  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  32.32 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  32.32 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0623  dephospho-CoA kinase  32.02 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  30.65 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00103  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.915308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3498  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0110  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  34.04 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0105  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00102  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1838  dephospho-CoA kinase  32.81 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.329616  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3555  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  hitchhiker  0.00141633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3179  dephospho-CoA kinase  34 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  31.34 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0108  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000883892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0107  dephospho-CoA kinase  32.2 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000727983  normal  0.646837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.33 
 
 
402 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2847  dephospho-CoA kinase  36.73 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00045648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0692  dephospho-CoA kinase  31.13 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.33 
 
 
402 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  32.65 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2003  dephospho-CoA kinase  32.47 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000053909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  32.82 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  29.79 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  31 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  32.82 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  31.84 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0096  dephospho-CoA kinase  31.71 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  32.64 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  30.52 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1252  dephospho-CoA kinase  33.5 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.324295  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  31.61 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.139689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  33.5 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0662  dephospho-CoA kinase  33.53 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  31.84 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  34.15 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  33.17 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  31.09 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  29.53 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  31.63 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  32.46 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  31.34 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  31.84 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  31.44 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  31.91 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  30.57 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0282  dephospho-CoA kinase  30.05 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  32.81 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  32.11 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1460  dephospho-CoA kinase  29.35 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1488  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.270343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>