42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1820 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1820  KH domain protein  100 
 
 		 93 aa  186  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  35.06 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  33.77 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  33.8 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  32.47 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  32.05 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  27.85 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  32.47 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  31.17 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  35.62 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  29.87 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  32.47 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  32.47 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  29.87 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  32.89 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  27.38 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2407  RNA binding protein  32.47 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3681  hypothetical protein  34.62 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  37.1 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  27.27 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  29.17 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  31.17 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  31.17 
 
 		 76 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  29.17 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  29.17 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  29.17 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  29.87 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1301  KH domain protein  29.17 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  4.49317e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  31.15 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  26.92 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  29.87 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  33.77 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  26.92 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  29.87 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  29.11 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  24.36 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  28.57 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  31.17 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>