33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0988 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 271 aa  567  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  57.52 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  56.44 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  55.76 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  55.3 
 
 		 267 aa  318  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  42.05 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  41.29 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  41.6 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  41.35 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 291 aa  205  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  41.29 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  40.61 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  41.13 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  28.34 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  26.32 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  26.72 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  25.97 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  24.33 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  24.33 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  27.05 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  32.06 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  26.47 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  21.94 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.68 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  38.1 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  29.36 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  27.56 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>