18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5987 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  348  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09170  hypothetical protein  57.78 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  41.06 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  36.59 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  38.31 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1976  hypothetical protein  37.76 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1910  hypothetical protein  37.76 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1930  hypothetical protein  37.76 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.900616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  39.84 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2840  hypothetical protein  34.07 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  37.04 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3208  hypothetical protein  34.04 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  33.68 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  31.53 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1273  hypothetical protein  33.73 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3610  hypothetical protein  36.28 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>