14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5367 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  48.12 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  37.75 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0851  hypothetical protein  42.31 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0264  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  35.25 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  34.78 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  36.88 
 
 		 154 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  36.51 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1626  hypothetical protein  34.92 
 
 		 117 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.34451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  37.32 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  36.25 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  27.52 
 
 		 154 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>