23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5313 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5313  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 1013 aa  1939    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0569792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0349  lanthionine synthetase C family protein  43.51 
 
 		 996 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3731  Lanthionine synthetase C family protein  39.46 
 
 		 1012 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760247 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  30.89 
 
 		 1058 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1868  lanthionine synthetase C family protein  28.62 
 
 		 1080 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1107  Lanthionine synthetase C family protein  24.11 
 
 		 1040 aa  314  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0940946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3486  Lanthionine synthetase C family protein  30.86 
 
 		 1093 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1243  lanthionine synthetase (lantibiotic biosynthesis)  24.01 
 
 		 989 aa  262  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3047  Lanthionine synthetase C family protein  28.13 
 
 		 1088 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.318736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3979  Lanthionine synthetase C family protein  29.09 
 
 		 1117 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.027595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5238  Lanthionine synthetase C family protein  27.3 
 
 		 1129 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2897  Lanthionine synthetase C family protein  26.63 
 
 		 1126 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.965177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3738  lanthionine synthetase C-like  32.82 
 
 		 611 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4441  Lanthionine synthetase C family protein  29.63 
 
 		 959 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  22.47 
 
 		 1078 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  22.68 
 
 		 1078 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  26.89 
 
 		 1074 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1651  lantibiotic modifying enzyme  25.82 
 
 		 1033 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21071  MrsD-like protein  28.6 
 
 		 1068 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.365739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6089  lanthionine synthetase C family protein  27.91 
 
 		 973 aa  137  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4908  putative lantibiotic modification protein  34.47 
 
 		 568 aa  135  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09700  lantibiotic modifying enzyme  23.23 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  23.74 
 
 		 713 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>