18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3507 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  40.98 
 
 		 469 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  37.47 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  36.88 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  36.88 
 
 		 439 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  36.88 
 
 		 439 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  36.96 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  34.58 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  33.41 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  35.94 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  34.04 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  35.4 
 
 		 463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  32.5 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  37.82 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  31.41 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  35.39 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  34.3 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>