13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3186 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  60.26 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  39.02 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  39.47 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  40.58 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  33.75 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  33.75 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2184  hypothetical protein  36.49 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3253  hypothetical protein  35.48 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>