36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3166 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  39.07 
 
 		 154 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  35.92 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  40.54 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  34.69 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  32.19 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  37.34 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  31.79 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  33.12 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  39.31 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  38.62 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  38.62 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  38.62 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  38.62 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  35.1 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  36.49 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  32.87 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  37.11 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  35.67 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  34.25 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  43.48 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  29.75 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  31.03 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  31.01 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  39.53 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  35.15 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  30.34 
 
 		 295 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  31.08 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  34.27 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  33.55 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  34.53 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  39.8 
 
 		 172 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  47.5 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  28.76 
 
 		 340 aa  42  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>