88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0921 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0921  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  100 
 
 
483 aa  925    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.19 
 
 
491 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5289  cell division protein FtsK/SpoIIIE  43.34 
 
 
476 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4272  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.87 
 
 
530 aa  297  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000868926  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0696  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  40.57 
 
 
484 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0042  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.73 
 
 
455 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.51 
 
 
499 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  hitchhiker  0.00205824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0152  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  42.3 
 
 
481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.62 
 
 
517 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.92 
 
 
519 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5523  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.52 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.79 
 
 
519 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.94 
 
 
523 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0430668 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5993  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.67 
 
 
480 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000693624 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5592  cell division FtsK/SpoIIIE  39.67 
 
 
480 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.95 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3229  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.95 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0446654  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3167  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.95 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.859597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0634  cell division FtsK/SpoIIIE  40.1 
 
 
460 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.22 
 
 
474 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3398  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.7 
 
 
560 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000750555  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1288  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.18 
 
 
456 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1142  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.39 
 
 
409 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  32.63 
 
 
450 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1568  cell division FtsK/SpoIIIE  33.71 
 
 
433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783737  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1113  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.18 
 
 
460 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8666  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  32.3 
 
 
450 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0593  cell division protein FtsK/SpoIIIE  30.19 
 
 
446 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000762932  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0084  cell division FtsK/SpoIIIE  31.68 
 
 
460 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.82 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4530  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.46 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  30.56 
 
 
526 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  28.57 
 
 
607 aa  57.8  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0632  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.38 
 
 
1679 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1370  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.86 
 
 
831 aa  53.5  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4147  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.02 
 
 
1502 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3390  cell division FtsK/SpoIIIE  31.65 
 
 
1477 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1419  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
1468 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.49197  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl100  DNA translocase (stage III sporulation protein E)  28.35 
 
 
953 aa  52.4  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.7 
 
 
1229 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.7 
 
 
1229 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3724  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.55 
 
 
366 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.36 
 
 
1463 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2124  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.03 
 
 
1579 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1871  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.33 
 
 
655 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1302  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  26.94 
 
 
1528 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4588  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.4 
 
 
1812 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.35 
 
 
1229 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  26.83 
 
 
1484 aa  50.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.95 
 
 
2947 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.94 
 
 
1446 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0763  DNA segregation ATPase  28.57 
 
 
608 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0457754  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  28 
 
 
1363 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6269  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.93 
 
 
703 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  30.92 
 
 
1488 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25.25 
 
 
833 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06250  putative FtsK/SpoIIIE-like protein  25.23 
 
 
798 aa  47  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.996423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1095  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.27 
 
 
808 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4959  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.74 
 
 
1183 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156858  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.51 
 
 
822 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.11 
 
 
788 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1362  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25.11 
 
 
788 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.174513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0843  FtsK/SpoIIIE family protein  23.35 
 
 
797 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.83 
 
 
825 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.83 
 
 
823 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04110  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  28.12 
 
 
1360 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3333  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.93 
 
 
822 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  27.76 
 
 
1346 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0786  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.11 
 
 
830 aa  45.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0101179  normal  0.147474 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0821  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE  30.4 
 
 
924 aa  44.3  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.42 
 
 
872 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1654  ATPase  25.73 
 
 
533 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.815556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3838  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.13 
 
 
636 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1420  cell division FtsK/SpoIIIE  25.85 
 
 
776 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.538178  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1030  putative cell division protein FtsK  27.54 
 
 
945 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.456142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2359  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.24 
 
 
825 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.967917  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5334  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.26 
 
 
1736 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0405049  normal  0.265694 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0965  cell division protein FtsK, putative  27.54 
 
 
941 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0418  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.76 
 
 
814 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.124101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0439  cell divisionFtsK/SpoIIIE  20.8 
 
 
763 aa  43.9  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0859833 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0893  cell division protein FtsK, putative  27.54 
 
 
946 aa  43.9  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  23.58 
 
 
770 aa  43.9  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.55 
 
 
888 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2470  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.34 
 
 
1249 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.923586  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  23.88 
 
 
765 aa  43.5  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1771  cell division FtsK/SpoIIIE  28.44 
 
 
894 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.24 
 
 
881 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1164  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.55 
 
 
907 aa  43.5  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.804507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>