251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0606 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  87.27 
 
 		 54 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3292  ribosomal protein L33  87.27 
 
 		 54 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4730  50S ribosomal protein L33  87.27 
 
 		 54 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4816  50S ribosomal protein L33  87.27 
 
 		 54 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.504852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  83.64 
 
 		 54 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  96.7  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1311  50S ribosomal protein L33  88.24 
 
 		 54 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 54 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  83.64 
 
 		 54 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  93.6  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  84 
 
 		 56 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  80 
 
 		 54 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  89.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 54 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12094  50S ribosomal protein L33  83.64 
 
 		 54 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1278  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.415692  normal  0.0543847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 54 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 57 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000410217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 56 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  57.14 
 
 		 51 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 56 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12292  predicted protein  56.36 
 
 		 57 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.855117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2816  ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480398  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0147  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0204483  normal  0.0145707 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0792  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.696109  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2648  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7415  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0365906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1740  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33138  normal  0.392054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1771  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2107  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.680646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  57.14 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3181  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 56 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3215  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 55 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1499  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 		 55 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.612868  normal  0.102067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1350  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>