18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2702 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1185    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  59.73 
 
 
557 aa  588  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  65.83 
 
 
440 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  51.21 
 
 
455 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  53.79 
 
 
439 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  50.96 
 
 
424 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  51.04 
 
 
377 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  50.24 
 
 
451 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  43.79 
 
 
429 aa  349  6e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  37.3 
 
 
381 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  37.84 
 
 
373 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  25.51 
 
 
405 aa  104  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  25 
 
 
465 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  19.72 
 
 
444 aa  57.4  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  24.15 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  24.38 
 
 
462 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  23.6 
 
 
465 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  25.74 
 
 
457 aa  47  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>