More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1109 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1109  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
198 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.5 
 
 
199 aa  184  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.5 
 
 
199 aa  184  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0753  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.5 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49 
 
 
198 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.5 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.73 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.73 
 
 
195 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.5 
 
 
197 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.5 
 
 
197 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.5 
 
 
197 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
195 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.12 
 
 
194 aa  175  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.24674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.72 
 
 
195 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
195 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.19 
 
 
196 aa  174  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
196 aa  174  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.67 
 
 
196 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.22 
 
 
195 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43 
 
 
197 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.72 
 
 
195 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5338  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4897  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.67 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.03 
 
 
236 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.63 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.5 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.67 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.5 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0323  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.352379  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.11 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.67 
 
 
195 aa  171  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4919  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43 
 
 
197 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  hitchhiker  0.001484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2618  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
194 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.69 
 
 
203 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1527  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.67 
 
 
194 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49 
 
 
197 aa  170  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47 
 
 
196 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.7 
 
 
195 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.15 
 
 
195 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.72 
 
 
195 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.18 
 
 
195 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.63 
 
 
194 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0289  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  42.5 
 
 
210 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.72 
 
 
201 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0309  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  42.5 
 
 
210 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7048  decreased coverage  0.00641142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.69 
 
 
206 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1318  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.45 
 
 
194 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1291  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.45 
 
 
194 aa  168  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1292  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.45 
 
 
194 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.45 
 
 
194 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1566  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.67 
 
 
194 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1498  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.45 
 
 
194 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.18 
 
 
202 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0979  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
203 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal  0.358327 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.74 
 
 
208 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.46 
 
 
199 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.15 
 
 
198 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.11 
 
 
194 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.41 
 
 
201 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.6 
 
 
195 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0314  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  42 
 
 
197 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46 
 
 
203 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.28 
 
 
202 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.55 
 
 
201 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46 
 
 
203 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.55 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.5 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2805  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.5 
 
 
197 aa  164  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.23 
 
 
195 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.24 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.6 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0089  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.23 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.922879  normal  0.290643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0092  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.23 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.24 
 
 
198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.55 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.78 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1553  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.5 
 
 
195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.74 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.77 
 
 
209 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>