23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1538 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 163 aa  313  8e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  46.15 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  39.55 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  35.06 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  30.67 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  33.58 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  29.58 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  27.33 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  31.62 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  29.32 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  33.78 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1259  rod shape-determining protein MreD  26.42 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00973114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  28.12 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  40.66 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  41.94 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  29.31 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1804  signal transduction histidine kinase, LytS  31.51 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  22.83 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1822  rod shape-determining protein MreD  27.19 
 
 		 173 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  43.64 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  36.56 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0532  hypothetical protein  34.38 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1463  hypothetical protein  29.82 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.295212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>