19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1460 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1460  HEAT domain containing protein  100 
 
 
165 aa  330  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0030107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2257  hypothetical protein  27.34 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00129528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0437  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
489 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000498384  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0581  hypothetical protein  28.7 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.959352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3721  hypothetical protein  32.35 
 
 
127 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3916  hypothetical protein  30.3 
 
 
128 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0606194 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0700  hypothetical protein  28.72 
 
 
406 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
1201 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.25 
 
 
643 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1780  hypothetical protein  34.92 
 
 
131 aa  44.3  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.3 
 
 
831 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.54 
 
 
1094 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.72 
 
 
1328 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.5 
 
 
1041 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  27.61 
 
 
838 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  36.07 
 
 
1132 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1094  hypothetical protein  39.73 
 
 
80 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.7 
 
 
860 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.63 
 
 
958 aa  40.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>