18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0998 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0998  AIG2 family protein  100 
 
 
117 aa  239  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  55.77 
 
 
596 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  30.69 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  31.3 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  32.77 
 
 
115 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  30.43 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  34.51 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  29.63 
 
 
152 aa  43.5  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  27.72 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  26 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  26 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  34.72 
 
 
268 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  29.59 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  29.59 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  29.59 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  29.59 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  29.59 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  28.57 
 
 
135 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>