23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1505 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  157  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2845  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0068  hypothetical protein  51.67 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.471063 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08049  Lactobacillus shifted protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUI1]  54.29 
 
 
213 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2761  hypothetical protein  63.89 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622446  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4186  hypothetical protein  52.27 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2912  hypothetical protein  53.66 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2688  hypothetical protein  53.33 
 
 
59 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0965838  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1027  hypothetical protein  53.33 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  35.85 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0201  hypothetical protein  53.33 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  35.94 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  37.74 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  33.96 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  35.85 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  35.85 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1061  hypothetical protein  60.61 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1680  hypothetical protein  43.9 
 
 
60 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0412  hypothetical protein  42.31 
 
 
66 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2318  hypothetical protein  43.4 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1922  hypothetical protein  42.59 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  36.84 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>